ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ МЕТОДОВ ВЫДЕЛЕНИЯ РАСТИТЕЛЬНОЙ ДНК С МАЛЫМ ВРЕМЕНЕМ ЛИЗИСА И ОТСУТСТВИЕМ СТАДИИ ПРЕЦИПИТАЦИИ

Выделение ДНК, хотя и является рутинной процедурой, может представлять трудности, поскольку хозяйственно важные растения часто содержат различные вещества, негативно влияющие на качество выделенной ДНК и ее пригодность для ПЦР. Мы сравнили результаты выделения ДНК из подсолнечника и различных видов луков при использовании нескольких протоколов выделения ДНК и коммерческих наборов, пригодных для использования в полевых условиях. Использование коммерческих наборов «МагноПрайм ФАСТ» и «МагноПрайм ЮНИ» позволяет значительно сократить время выделения за счет уменьшения времени лизиса и отсутствия стадии преципитации. Получаемые препараты ДНК пригодны для проведения ПЦР на участки ядерного генома, которые используют как для филогенетических, так и для популяционных исследований.

Comparison of some plant DNA extraction methods

DNA isolation is a routine procedure when performed in laboratory environment, yet in the ield it may still remain problematic. This is especially true of some crop species bred for useful metabolites that may also hinder DNA extraction. Here we compare the efficiency of DNA extraction protocols and commercial DNA isolation kits when used on samples from Helianthus and Allium. Since extraction of DNA is known to be compromised by co-extraction of PCR-inhibiting metabolites, the isolation of DNA was followed by PCR as a testing procedure for the isolation step. The MagnoPrime Fast and MagnoPrime Uni DNA isolation kits were better suited for field work due to faster processing times and smaller required amount of starting material (20 mg fresh/0.5 mg dry). In all cases the subsequent PCR managed to amplify the DNA fragments of interest well enough to be useful in further research.