Набор праймеров для выявления возбудителя Acidovorax citrulli и способ выявления возбудителя Acidovorax citrulli

Группа изобретение относится к молекулярной микробиологии. Предложены набор праймеров и способ для выявления возбудителя Acidovorax citrulli в семенах и вегетативных частях растений семейства Cucurbitaceae. Праймеры специфичны к 16S рибосомальной РНК и представляют собой АС-1 F: 5'-ATGGTGTGTTCTTCGGGACC-3' (SEQ ID NO:А) и АС-1 R: 5'-ATCGGCGATCTCTTCGTGTC-3' (SEQ ID NO:В). Для выявления возбудителя A. citrulli получают ДНК из растительной ткани. Осуществляют амплификацию полученной ДНК с праймерами SEQ ID NO: A и SEQ ID NO: В. Начальную денатурацию проводят при 96°C в течение 5 мин. Далее проводят 35 циклов денатурации при 96°C в течение 5 с. Осуществляют отжиг при 63°C в течение 30 с и элонгацию при 72°C в течение 30 с. Финальную элонгацию проводят при 72°C в течение 5 мин. Детектируют продукт амплификации методом электрофореза. Изобретения обеспечивают высокую чувствительность, позволяя выявлять A. сitrulli в концентрации до 102 КОЕ/мл, а также приводят к сокращению времени анализа. 2 н.п. ф-лы, 3 ил., 3 пр.