Молекулярно-генетический анализ эпидемических штаммов вируса гриппа А на основе нуклеотидной последовательности генов М2 и нейраминидазы

В работе представлены результаты молекулярно-генетического анализа эпидемических штаммов гриппа А, изолированных на территории Российской Федерации в период с 1995 по 2007 г. Анализ проводили на основе последовательностей генов нейраминвдаэы (NA) и белка М2 вируса гриппа А. Для выявления мутаций в вирусном геноме проанализировано 15 штаммов подтипа À(H3N2) и 17 штаммов подтипа A (H1N1). Анализ полученных аминокислотных последовательностей белка М2 показал, что все штаммы, устойчивые к римантадину, содержат мутацию S31N - основной маркер резистентности. Показано, что для каждого подтипа вируса были выявлены дополнительные мутации как в белке М2，так и в NA, которые в силу их совместного присутствия с заменой S31N могут рассматриваться в качестве потенциальных маркеров для идентификации штаммов, устойчивых к римантадину. Анализ последовательности NA обоих подтипов вируса гриппа не выявил присутствия известных маркерных мутаций резистентности к ингибиторам NA, что позволяет судить о чувствительности исследуемых штаммов к препаратам данной группы.

Molecular and Genetic Analysis of Influenza A Viruses Isolated in Russia, Based on the Neuraminidase and М2 Protein Gene Sequence

The results of molecular analysis of 15 influenza A(H3N2) and 17 - A(H1N I) epidemic strains isolated in the Russian Federation in 1995-2007 are described. The analysis on the М2 and neuraminidase influenza A virus genes was performed. The М2 sequences analysis among the remantadin resistant viruses demonstrated the S3 IN substitution in all strains. Besides S3 IN substitution, additional mutations were detected in both proteins. Mutations associated with S31N substitution were detected in each virus subtype, which may be considered as new markers for the identification of remantadin-resistant strains. The sequencing of the NA segments from alf viruses showed no amino acid substitutions known to cause resistance to neuraminidase inhibitors, which indicates susceptibility to NA inhibitors among the strains.