Возможности газовой хромато-масс-спектрометрии микробных маркеров при диагностике пародонтогенной микрофлоры в полости рта

В рамках проведенного нами исследования оценивались микробные сообщества у пациентов с периимплантитом с использованием таких методов методов диагностики,как ПЦР, метагеномное секвенирование 16s и ГХ-МС. Целью исследования была оценка корреляции результатов, полученных в результате методов ПЦР, метагеномного секвенирования 16s и ГХ-МС. Материалы и методы. Проведено исследование слюны 10 пациентов с хроническим периимплантитом в возрасте от 18 до 80 лет. Результаты. Полученные данные ПЦР подтвердили наличие основных пародонтопатогенов, таких как P. endodontalis, P. gingivalis, A. actinomycetemcomitans, T. denticola, P. intermedia, T. forsythia и F. nucleatum. Метагеномное секвенирование позволило выявить не только присутствие, но и количество этих бактерий, демонстрируя их доминирование в микробиоме. ГХ-МС анализы выявили повышенные концентрации некоторых родов бактерий и показали, что 54,25% микроорганизмов относились к условно-патогенным, что подчеркивает нарушение микроэкологического статуса в ротовой полости пациентов. Полученные данные указывают на снижение разнообразия родов и видов в микробиоме, что поддерживает теорию о том, что поддержание воспалительного процесса при периимплантите связано с дисбиотическими изменениями в микробном сообществе, приводящими к доминированию патогенных видов и прогрессированию заболевания.

As part of our study, microbial communities in patients with peri-implantitis were evaluated using diagnostic methods such as PCR, 16s metagenomic sequencing and GC-MS. The aim of the study was to evaluate the correlation of the results obtained as a result of PCR, 16s metagenomic sequencing and GC-MS methods. Materials and methods. The saliva of 10 patients with chronic peri-implantitis aged 18 to 80 years was studied. Results. The obtained PCR data confirmed the presence of major periodontal pathogens such as P. endodontalis, P. gingivalis, A. actinomycetemcomitans, T. denticola, P. intermedia, T. forsythia and F. nucleatum. Metagenomic sequencing revealed not only the presence but also the number of these bacteria, demonstrating their dominance in the microbiome. GC-MS analyses revealed elevated concentrations of certain bacterial genera and showed that 54.25% of microorganisms were conditionally pathogenic, which highlights the violation of the microecological status in the oral cavity of patients. The data obtained indicate a decrease in the diversity of genera and species in the microbiome, which supports the theory that the maintenance of the inflammatory process in peri-implantitis is associated with dysbiotic changes in the microbial community, leading to the dominance of pathogenic species and the progression of the disease.