EDITORIAL: APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE, MACHINE LEARNING, AND DEEP LEARNING IN PLANT BREEDING СтатьяЕфтекхари М., Ма Ч., Орлов Ю.Л.Frontiers in Plant Science. Том 15. 2024. 1420938 с.
IN VITRO VS. IN VIVO TRANSCRIPTOMIC APPROACH REVEALED CORE PATHWAYS OF NITROGEN DEFICIENCY RESPONSE IN TEA PLANT (CAMELLIA SINENSIS (L.) KUNTZE) СтатьяОрлов Ю, Самарина Л, Малюкова Л, Ванг С, Бобровских А, Дорошков А, Шхалахова Р, Манахова К, Конинская Н, Мацкив А, Рындин А, Хлесткина ЕInternational Journal of Molecular Sciences. Том 25. 2024. 11726 с.
SMARTCROP COGNITIVE PLATFORM: MODULES FOR AUTOMATIC KNOWLEDGE EXTRACTION FROM SCIENTIFIC PUBLICATIONS, PATENTS AND FACTUAL DATABASES FOR RECONSTRUCTION AND ANALYSIS OF GENE NETWORKS OF STRESS RESPONSE IN RICE AND WHEAT СтатьяIvanisenko V.A., Demenkov P.S., Ivanisenko T.V., Antropova E.A., Volyanskaya A.R., Zubairova U.S., Makarova A.A., Orlov Y.L., Chen M.Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология: четырнадцатая международная мультиконференция : тезисы докладов. Новосибирск, 05-10 августа 2024 г.. 2024. С. 2188-2190
ЭВОЛЮЦИЯ БЕЛКОВ, ПОХОЖИХ НА АКТИВАТОРЫ ТРАНСКРИПЦИИ (TALES) У ФИТОПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ И ДРУГИХ ОРГАНИЗМОВ СтатьяГайсина Э.М., Кырова Е.И., Орлов Ю.Л., Игнатов А.Н.Plamic2024. 2024. С. 114-115
STRUCTURAL FEATURES OF DNA IN TRNA GENES AND THEIR UPSTREAM SEQUENCES СтатьяОрлов Ю.Л., Савина Е.А., Шумилина Т.Г., Пороло В.А., Лебедев Г.С., Анашкина А.А., Ильичева И.А.International Journal of Molecular Sciences. Том 25. 2024. 11758 с.
BGRS: BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND DATA INTEGRATION СтатьяOrlov Y.L., Chen Ming, Kolchanov N.A., Hofestädt RalfJournal of Integrative Bioinformatics. Том 20. 2024.
A PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS AND FUNCTIONAL ANNOTATION OF DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES IN BRAIN REGIONS OF GRAY RATS SELECTED FOR TAME OR AGGRESSIVE BEHAVIOR СтатьяЧадаева Ирина, Кожемякина Римма, Шихевич Светлана, Богомолов Антон, Кондратюк Екатерина, Ощепков Дмитрий, Орлов Юрий Л., Маркель Аркадий Л.International Journal of Molecular Sciences. Том 25. 2024. 4613 с.
OVEREXPRESSION OF RPOTMP BEING TARGETED TO EITHER MITOCHONDRIA OR CHLOROPLASTS IN ARABIDOPSIS LEADS TO OVERALL TRANSCRIPTOME CHANGES AND FASTER GROWTH СтатьяОрлов Ю.Л., Горбенко И.В., Тарасенко В.И., Гарник Е.Ю., Яковлева Т.В., Катышев А.И., Белков В.И., Константинов Ю.М., Кулинченко М.В.International Journal of Molecular Sciences. Том 25. 2024. 816 с.
APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE, MACHINE LEARNING, AND DEEP LEARNING IN PLANT BREEDING СтатьяEftekhari M., Ma C., Orlov Y.L.Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология: четырнадцатая международная мультиконференция : тезисы докладов. Новосибирск, 05-10 августа 2024 г.. 2024. С. 1136-1137
A PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS AND FUNCTIONAL ANNOTATION OF DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES IN BRAIN REGIONS OF GRAY RATS SELECTED FOR TAME OR AGGRESSIVE BEHAVIOR СтатьяChadaeva I., Kozhemyakina R., Shikhevich S, Bogomolov A., Kondratyuk E., Oshchepkov D., Orlov Y.L., Markel A.L.Биоинформатика регуляции и структуры геномов / системная биология: четырнадцатая международная мультиконференция : тезисы докладов. Новосибирск, 05-10 августа 2024 г.. 2024. С. 908-910
СТАТИСТИЧЕСКИЕ ОЦЕНКИ КЛАСТЕРИЗАЦИИ САЙТОВ СВЯЗЫВАНИЯ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ В ГЕНОМАХ РАСТЕНИЙ СтатьяДергилев А.И., Иванисенко В.А., Орлов Ю.Л., Чен М.СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VII СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ. 2023. С. 351-352
РЕКОНСТРУКЦИЯ И АНАЛИЗ РЕГУЛЯТОРНОЙ ГЕННОЙ СЕТИ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ КЛЕТОЧНОЙ СТЕНКИ ЛИСТЬЕВ ARABIDOPSIS THALIANA L. ПРИ ОТВЕТЕ НА ВОДНЫЙ ДЕФИЦИТ СтатьяVolyanskaya A.R., Antropova E.A., Zubairova U.S., Demenkov P.S., Venzel A.S., Orlov Y.L., Makarova A.A., Ivanisenko T.V., Gorshkova T.A., Aglyamova A.R., Kolchanov N.A., Chen M., Ivanisenko V.A.Вавиловский журнал генетики и селекции. Том 27. 2023. С. 1031-1041
КОМПЬЮТЕРНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ СЕТЕЙ БЕЛОК-БЕЛКОВЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ: ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫЕ И ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЕ АСПЕКТЫ СтатьяОрлов Ю.Л., Туркина В.А., Орлова Н.Г., Анашкина А.А., Савина Е.А.СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ VII СЪЕЗДА БИОФИЗИКОВ РОССИИ. 2023. С. 312-313
ANALYSIS OF FUNCTIONAL SINGLE-NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS (SNPS) AND LEAF QUALITY IN TEA COLLECTION UNDER NITROGEN-DEFICIENT CONDITIONS СтатьяSamarina Lidiia, Fedorina Jaroslava, Kuzmina Daria, Malyukova Lyudmila, Manakhova Karina, Kovalenko Tatyana, Matskiv Alexandra, Xia Enhua, Tong Wei, Zhang Zhaoliang, Ryndin Alexey, Orlov Y.L., Khlestkina E.K.International Journal of Molecular Sciences. Том 24. 2023. 14538 с.
BIOINFORMATICS TOOLS FOR THE SEQUENCE COMPLEXITY ESTIMATES СтатьяOrlov Y.L., Orlova N.G.Biophysical Reviews. Том 15. 2023. С. 1367-1378